提高开放性检索鉴定灵敏度的互补离子谱图策略

更新时间:2023-05-28

《质谱学报》2020年01期

【摘要】开放性检索通过放宽母离子质量偏差容忍度可实现一定质量偏差范围内所有修饰的鉴定。由于开放性检索完全依赖于肽段子离子的匹配而基本忽略谱图母离子的质量限制,使其区分正反库肽段的能力低于限制性检索。因此,开放性检索更依赖于二级谱精度。二级谱的质量精度越低,开放性检索的肽段鉴定灵敏度越低。互补离子谱图是由原谱图谱峰的互补离子组成的。原谱图和互补离子谱图随机匹配到相同反库肽段的概率远低于它们同时匹配到正库肽段的概率,以原谱图和互补离子谱图鉴定到相同肽段序列作为过滤条件,可以过滤掉80%以上的假阳性鉴定结果,从而在指定的假阳性率下显著地提高了开放性检索的肽段鉴定灵敏度。本方法在0.5u子离子质量误差容忍度下,相对常规开放性检索谱图鉴定量提高了116%,肽段序列鉴定量提高了97%。

【关键词】蛋白质组学开放式检索互补离子谱图鉴定灵敏度